Twist合成生物學建構文庫 助力標靶篩選、加速蛋白新藥開發優化最佳夥伴！
Twist合成生物學建構文庫
助力標靶篩選、加速蛋白新藥開發優化最佳夥伴！
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近日倍思特生物科技(ABreal)及Twist Bioscience共同主辦線上研討會，邀請到Twist亞太生物製藥業務發展經理Jay Yang，分享Twist如何透過合成生物學的文庫建構技術，成為加速生物製劑(biologics)探索、早期開發及優化的產學研合作夥伴。
Twist成立於2013年，並在2018年於美國納斯達克首次公開上市(IPO)，在臺總代理商為倍思特生技。其致力於合成生物學和基因體學，最大優勢為藉由結合矽晶片的獨家創新DNA合成平台，實現生物學工程的工業化。
Jay Yang表示，Twist的合成生物學服務，最大的優勢在於其DNA合成製造，在量和濃度上都具備高一致性(high uniformity)，有著領先業界的高精準度、錯誤率僅約為1:2000，能夠提供業者高品質的合成文庫，有效降低開發成本、方便下游產品的開發及優化。
他表示，Twist以DNA合成生物學為基礎，開發出多樣化服務，包括：合成基因(synthetic genes)、寡核苷酸池(oligo pools)、DNA突變體文庫(DNA variant libraries)、高通量抗體生成(high-throughput antibody production)，以及次世代定序(NGS)等，並一一說明服務的特色及優勢。
在合成基因方面，Jay Yang說明，Twist的合成基因片段大小可到1.8 kb，選殖基因(clonal gene)可到5.0 kb，今(2023)年將推出電子商務平台，未來客戶只需上網，上傳序列、選擇載體(vector)，就能由美國原廠生產後送至臺灣，並可追蹤訂單進度，還可為客戶提供客製化載體服務。
寡核苷酸池方面，則可和CRISPR基因編輯結合，成為用於基因體規模(genome-wide)的研究利器，快速篩選出疾病表現型(disease phenotype)背後的標靶，確立成藥的目標。
Jay Yang表示，Twist的服務有著池規模(pool size)無上限、彈性化，以及寡核苷酸長度(20 nt~300 nt)方便各式CRISPR篩選實驗設計使用等優點，現也推出選殖寡核苷酸池(cloned oligo pools)服務，為客戶省下選殖流程。
四大類變體文庫組合 讓科學家不再「稻草裡撈針」
而在文庫組合(libraries portfolio)方面，Jay Yang強調，建構篩選用的文庫最重要的就是品質(quality)。他形容，傳統建構文庫的技術雜質往往太多、產生許多隨機化多樣性(random diversity)、真正可用的序列較少，就像是在一堆稻草裡尋覓細針，但Twist的合成技術使更有效和準確的設計文庫，因此用Twist合成出文庫的實際有效多樣性(effective library diversity)規模相較之下就大上許多。
「Twist的文庫建構，就像是把針聚成針山、每條都是可用的序列，克服了耦合效率(coupling efficiency)隨著片段長度變化的挑戰。此外，還能配合需求，為客戶排除掉不想要的蛋白質結構模體(motif)，讓科學家可以更精準設計，客製化所需的變體文庫。」他形容。
Twist現也建立了四大類型的文庫，涵蓋從治療性蛋白質到細胞療法，包括：方便篩選位點的SSVL(site saturation variant library)；用於抗體探勘與優化的CVL(combinatorial variant library)；提升蛋白質工程效力的SOLD (spread out low diversity library)；可用在CAR-T、TCR-T細胞療法優化的CAL (combinatorial assembly library)等。
Jay Yang總結，Twist的優勢體現在三大面向：
一、建立「由文庫組成的文庫」(library of libraries)，即多款不同的變異文庫提供篩選。
二、透過高精準度、低雜質、高品質的文庫內容，幫助業者節省成本。
三、透過微型化和自動化，在很短的時間內將服務提供給客戶，期待成為蛋白質探索、早期開發及優化的最佳夥伴。
研討會影片網址：
https://www.youtube.com/watch?v=hzGneDLNZ-o
環球生技文章：
https://news.gbimonthly.com/tw/article/show.php?num=55993&page=1&category=&kw=Twist
