Twist 多重基因片段(Multiplexed Gene Fragments)文庫之優勢&應用
Twist Multiplexed Gene Fragments (多重基因片段文庫)
之優勢&應用
Twist Bioscience 的矽基 DNA 平台寫入技術能夠大規模並行生產高品質的寡核苷酸。利用 Twist 的規模效率和卓越的 DNA 合成能力,Twist 的 Multiplexed Gene Fragments (MGF) 為多達數十萬個長度在 301 到 500 個鹼基對之間的基因片段提供了獨特的 pool 形式。
在高通量篩選應用中,單一片段成本可能是獲得所需變體數量的一大障礙,然而這種pool形式可助力高通量篩選應用,如:引子編輯、基於CRISPR 的超複雜功能篩選、多肽和蛋白質工程、抗體發現、以及大規模平行報告分析(MPRA)。
Twist Multiplexed Gene Fragments (MGF) 優勢
1. 設計靈活
• 大規模多重片段合成,靈活可訂製
2. 擴展性強
• 長度可達500bp,適用於高通量篩選
3. 行業領先的高品質片段
• 高品質,低錯誤率(1:2000)
4. 產量高均一性
• 無論長度和GC含量如何,都有穩定表達量
主要應用領域
1. MPRA screens (Massively Parallel Reporter Assays)
- 進行UTR/mRNA優化篩選
2. mRNA Vaccine Development
- 設計涵蓋整個感興趣區域的編碼,以篩選表達水平、半衰期和增強的RNA穩定性。
3. High Throughput Screening For AI/ML Design
- 多重基因片段的高度均一性和表達性使AI設計幾乎達到 100%,從而提高了選擇能力
- 不會因拼接 300mers而導致完整AI設計的表達性不足
4. Antibody and Nanobody Discovery/Engineering
- 實現抗體開發實驗設計和所需的完整且準確的序列
5. Ultra Complex CRISPR and Parired-Prime Editing Screens
長達500bp的長度,讓您可以
- 容納更多串聯重複序列,用於更複雜的篩選
- 以高標靶效率敲除(Knockout)多個基因
透過提供長度不超過 500 個鹼基對、數量不限的基因片段,許多以前不可行或成本高昂的高多樣性篩選應用現在成為可能。例如,完整的奈米抗體 (VHH) 序列可以容納在一個片段中,使研究人員可以設計任意數量的獨特抗體序列,無任何限制。
對於較大的抗體,一些研究人透過拼接 MGFs 池,以產生完美匹配的重鏈/輕鏈組合,進行大規模的抗體工程篩選。為了在 CRISPR 實驗中針對多基因家族或廣泛的基因組區域,可以在一個 MGF 內設計多個 gRNA 序列,以精確組合的方式探討基因功能。
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